「シナぷしゅ」の番組名の由来は脳の神経細胞と神経細胞の間にあるつなぎ目である「シナプス」で、コンテンツを見ることでシナプスをどんどん増やし、脳の発達につなげ、「ぷしゅっ」と赤ちゃんの世界を広げ、保護者の肩の力を「ぷしゅ～」と抜くという意味が込められていると、テレビ東京の飯田佳奈子氏